就在今天,朋友圈和各种聊天群都在转发一个十万人基因组计划:
这个“中国十万人基因组计划”,这是我国在人类基因组研究领域实施的首个重大国家计划,也是目前世界最大规模的人类基因组计划。覆盖地域包含我国主要地区,涉及人群除汉族外,还将选择人口数量在500万以上的壮族、回族等9个少数民族。
按照计划,整个项目将在四年内完成全部的测序与分析任务,这也将是当前世界上推进速度最快的基因组工程。
看到这样的消息,我还在思考,我可以做些什么,我们生信技能树团队能做些什么?
还没回过神来,VIP聊天群的大佬就转发了一个江苏省的百万人基因组计划。
该计划的主要实施内容包括:
一是建立6个队列,包括20万新生儿队列、20万儿童脑与认知发展队列、20万恶性肿瘤队列、5万罕见疾病队列、10万慢病队列、25万自然人群遗传多样性队列。
二是建设全基因组测序及数据中心,建立个体表型组学数据库、生物样本库和生物组学数据库,进行全面的分析和挖掘,发现与疾病相关的基因组变异,解析中国人的遗传多样性。
三是加强数据安全与隐私保护,产生的所有数据均集中保存到健康医疗大数据中心,所有权归国家,经国家相关部门授权后由扬子国资投资集团统一管理,整个数据库计划3-4年内完成。
看完,我更加蒙圈了,目前大家都热火朝天的忙着挖掘TCGA的一万多癌症病人的测序信息,感觉都力不从心,各种层面,各种调控,有点类似于要把整个生物学基础知识全部用NGS测序数据重新解释一波。
往国内看:
海普洛斯有一个万人基因组计划应该完成了。
吉因加有一个已完成的四万人的肿瘤样本队列。
裕策生物的天梯计划的万人级别的3D肿瘤数据库。
国际上:
人类长寿公司也有一万多全基因组测序数据了。
GTEX现在应该是有449名生前健康的人类捐献者的7000多份尸检样本的测序数据了吧。
Foundation Medicine Inc也有10万肿瘤病人的CGP数据。
MSKCC医院也有好几万的捕获基因组测序数据了吧。
英国好像还有一个UK10K,不知道进行的咋样了。
前面还在想,我们可以做什么,发现自己没有独立的服务器,没有几百T的硬盘,也没有全职的团队,好多事想做却一直没办法落地,按照兴趣来做自己的研究是好的,但是如果想带领一个团队,事情往往就没那么简单了。
但是我们有了非常完善的技术团队(兼职),小但是正规的办公室一间,非常活跃的技能树联盟VIP会员们,还有这十几万的关注,可以说不管是在中国执行啥大的测序计划,真正做事的那批人肯定是我们的粉丝。毕竟所谓的首席科学家、项目执行者应该是不会去收样品,测序,上传数据,整理样本信息表格吧。
那么,我们应该是可以做点什么的。
是什么呢?